More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2369 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1146 aa  2378    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 
1465 aa  882    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
713 aa  531  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
683 aa  466  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
1021 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.66 
 
 
1260 aa  393  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 
1260 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.59 
 
 
392 aa  325  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1893  putative PAS/PAC sensor protein  42.48 
 
 
879 aa  313  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.14 
 
 
678 aa  305  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 
681 aa  298  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.18 
 
 
679 aa  287  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  51.55 
 
 
439 aa  284  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  46.98 
 
 
358 aa  283  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  52.42 
 
 
681 aa  283  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  52.63 
 
 
611 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
675 aa  281  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.38 
 
 
589 aa  281  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
685 aa  281  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.61 
 
 
602 aa  280  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.88 
 
 
611 aa  280  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.88 
 
 
611 aa  280  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.24 
 
 
594 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
683 aa  278  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  50 
 
 
408 aa  278  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  50 
 
 
408 aa  278  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  49.65 
 
 
305 aa  278  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  52.61 
 
 
1187 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  50 
 
 
524 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.81 
 
 
553 aa  273  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  46.98 
 
 
389 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 
467 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1253  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
673 aa  272  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  50.38 
 
 
626 aa  271  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  46.98 
 
 
389 aa  271  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  46.98 
 
 
358 aa  271  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  46.98 
 
 
389 aa  271  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  46.98 
 
 
389 aa  271  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  46.98 
 
 
389 aa  271  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  46.98 
 
 
358 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  51.06 
 
 
406 aa  271  5.9999999999999995e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
591 aa  269  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  51.13 
 
 
627 aa  265  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  51.13 
 
 
627 aa  265  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  51.13 
 
 
627 aa  265  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  51.13 
 
 
627 aa  265  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  51.13 
 
 
627 aa  265  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  51.13 
 
 
627 aa  265  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  51.13 
 
 
627 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  52.14 
 
 
310 aa  261  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  42.42 
 
 
505 aa  260  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
467 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  48.41 
 
 
470 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  46.64 
 
 
445 aa  253  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  41.98 
 
 
429 aa  244  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3608  sensor histidine kinase  45.68 
 
 
313 aa  239  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3474  histidine kinase  45.35 
 
 
449 aa  238  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  41.52 
 
 
708 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
971 aa  237  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3259  sensor histidine kinase  43.88 
 
 
598 aa  235  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
557 aa  232  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2775  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.19 
 
 
933 aa  232  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2403  sensor histidine kinase  45.03 
 
 
601 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1123  sensor histidine kinase  45.03 
 
 
471 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0677  sensor histidine kinase  45.03 
 
 
538 aa  228  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.755053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
688 aa  228  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  42.14 
 
 
433 aa  228  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  42.86 
 
 
308 aa  227  8e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
1036 aa  227  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0788  sensor histidine kinase  45.03 
 
 
465 aa  227  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105833  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1200  sensor histidine kinase  45.03 
 
 
471 aa  227  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  43.12 
 
 
315 aa  225  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1588  sensor histidine kinase  46.58 
 
 
502 aa  225  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153224  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1533  histidine kinase  42.29 
 
 
497 aa  224  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  40.13 
 
 
1850 aa  223  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  39.3 
 
 
724 aa  223  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
468 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.05 
 
 
1795 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  40.21 
 
 
730 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  41.49 
 
 
457 aa  221  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
928 aa  221  7.999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
1072 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  26.96 
 
 
917 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 
1222 aa  219  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  39.81 
 
 
468 aa  219  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  41.07 
 
 
371 aa  218  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.05 
 
 
1780 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
407 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
566 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2365  histidine kinase  40.82 
 
 
435 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
585 aa  215  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
440 aa  214  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 
1108 aa  213  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
443 aa  212  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0967  sensor histidine kinase  40.82 
 
 
401 aa  211  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
715 aa  211  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2546  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.49 
 
 
804 aa  211  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  29.03 
 
 
1005 aa  210  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  36.69 
 
 
458 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 
644 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>