More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3259 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3259  sensor histidine kinase  100 
 
 		 598 aa  1225    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 		 467 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  45.7 
 
 		 505 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 683 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  45.93 
 
 		 1187 aa  253  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  45.39 
 
 		 358 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.99 
 
 		 1465 aa  246  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  44.8 
 
 		 429 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 		 389 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  45.21 
 
 		 358 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  45.21 
 
 		 389 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  45.21 
 
 		 358 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  45.21 
 
 		 389 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  45.21 
 
 		 389 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  45.21 
 
 		 389 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 553 aa  243  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  42.7 
 
 		 305 aa  243  9e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 		 1021 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 1146 aa  242  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  44.64 
 
 		 626 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 611 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 611 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  44.87 
 
 		 681 aa  236  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 		 594 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  41.7 
 
 		 408 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  41.7 
 
 		 408 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 679 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 589 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  41.9 
 
 		 611 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 		 602 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  43.26 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  39.93 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  41.01 
 
 		 627 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  41.01 
 
 		 627 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  41.01 
 
 		 627 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  41.01 
 
 		 627 aa  231  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  41.01 
 
 		 627 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  41.01 
 
 		 627 aa  231  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  41.01 
 
 		 627 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  44.53 
 
 		 524 aa  229  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  41.89 
 
 		 310 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 678 aa  229  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 		 713 aa  227  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 557 aa  227  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 392 aa  226  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  40.69 
 
 		 439 aa  225  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 470 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1533  histidine kinase  40.97 
 
 		 497 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 566 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3608  sensor histidine kinase  41.05 
 
 		 313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 683 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 1072 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  38.51 
 
 		 708 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  38.36 
 
 		 730 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  37.59 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1588  sensor histidine kinase  38.59 
 
 		 502 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153224  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1200  sensor histidine kinase  34.44 
 
 		 471 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  36.77 
 
 		 770 aa  204  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0788  sensor histidine kinase  34.17 
 
 		 465 aa  203  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105833  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2403  sensor histidine kinase  33.42 
 
 		 601 aa  203  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1123  sensor histidine kinase  34.17 
 
 		 471 aa  203  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0677  sensor histidine kinase  33.16 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.755053  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  33.59 
 
 		 785 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  34.08 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  33.55 
 
 		 371 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  38.85 
 
 		 468 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 785 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 680 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  38.57 
 
 		 1797 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  36.09 
 
 		 724 aa  198  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  38.36 
 
 		 1780 aa  197  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 715 aa  197  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 594 aa  196  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 971 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  36.27 
 
 		 315 aa  196  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  36.84 
 
 		 308 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 407 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 437 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 1036 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 928 aa  194  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3474  histidine kinase  33.45 
 
 		 449 aa  193  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0861  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339041  normal  0.260174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 688 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5447  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.85 
 
 		 1808 aa  190  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  35.8 
 
 		 1850 aa  190  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 699 aa  190  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 919 aa  189  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1953  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  36.27 
 
 		 726 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  37.62 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  38.98 
 
 		 1795 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  37.99 
 
 		 1811 aa  187  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  36.18 
 
 		 715 aa  187  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  37.76 
 
 		 1794 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  36.79 
 
 		 1901 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 641 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>