More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4645 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 644 aa  1304    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4350  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 686 aa  280  9e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4373  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 		 687 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0865062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4217  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 		 686 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 990 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 823 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 1465 aa  263  8e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4367  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 800 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.522603  normal  0.113968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 614 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5744  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 510 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 		 688 aa  250  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 848 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 634 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 850 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 850 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1771  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 923 aa  234  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 1146 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 637 aa  220  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 683 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 647 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 713 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 		 682 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 683 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 1021 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 679 aa  211  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  30.42 
 
 		 737 aa  207  5e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 		 498 aa  204  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.988505  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 844 aa  203  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 557 aa  201  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 		 842 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  36.34 
 
 		 505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 678 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  29.78 
 
 		 1258 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 553 aa  197  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 		 641 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 467 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5165  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 593 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1970  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 602 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316288  normal  0.365319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 467 aa  195  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  42.48 
 
 		 611 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 		 652 aa  195  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.74 
 
 		 819 aa  193  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  39.06 
 
 		 310 aa  193  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 611 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 611 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  38.75 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  36.23 
 
 		 439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 		 1079 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  39.93 
 
 		 524 aa  191  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 553 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 		 600 aa  190  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  38.58 
 
 		 681 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 695 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 		 589 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 		 804 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 		 622 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 630 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  36.4 
 
 		 457 aa  188  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  32.15 
 
 		 912 aa  187  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  26.89 
 
 		 1258 aa  187  7e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 1262 aa  186  9e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  41.54 
 
 		 358 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 		 829 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  31.54 
 
 		 1379 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0223  histidine kinase  32.95 
 
 		 647 aa  185  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3259  sensor histidine kinase  40.36 
 
 		 598 aa  185  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  37.55 
 
 		 308 aa  184  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  39.25 
 
 		 408 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  39.25 
 
 		 408 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 		 692 aa  184  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 		 653 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  40.91 
 
 		 406 aa  183  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  39.85 
 
 		 305 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  31.48 
 
 		 1092 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 470 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.83 
 
 		 869 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3081  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 		 638 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  39.12 
 
 		 626 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 602 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.89 
 
 		 650 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 566 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  37.96 
 
 		 433 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  28.57 
 
 		 812 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  34.58 
 
 		 770 aa  179  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  38.75 
 
 		 1187 aa  179  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  40 
 
 		 627 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 389 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  28.16 
 
 		 622 aa  179  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 		 622 aa  179  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  40 
 
 		 627 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  40 
 
 		 627 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  40 
 
 		 627 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  40 
 
 		 627 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  38.41 
 
 		 445 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  40 
 
 		 627 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  40 
 
 		 627 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  42.31 
 
 		 389 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  42.31 
 
 		 358 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  42.31 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>