More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2200 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  89.39 
 
 
850 aa  1437    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
848 aa  1660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  88.68 
 
 
850 aa  1428    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4350  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.61 
 
 
686 aa  328  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4373  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.86 
 
 
687 aa  323  6e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0865062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4217  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.22 
 
 
686 aa  320  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1771  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 
923 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4367  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 
800 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.522603  normal  0.113968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
990 aa  287  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5744  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
510 aa  286  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.08 
 
 
823 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.26 
 
 
688 aa  273  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 
614 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1970  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.23 
 
 
602 aa  248  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316288  normal  0.365319 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
860 aa  238  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
644 aa  235  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.26 
 
 
756 aa  227  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  29.15 
 
 
1092 aa  209  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
991 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
842 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
662 aa  206  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
817 aa  204  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 
801 aa  204  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5165  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
593 aa  204  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4799  hypothetical protein  27.46 
 
 
867 aa  203  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.6 
 
 
819 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
844 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  27.89 
 
 
737 aa  201  6e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
1509 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
654 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 
819 aa  197  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 
962 aa  194  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.79 
 
 
1015 aa  194  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
1193 aa  193  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 
804 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  31.6 
 
 
1379 aa  192  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 
1309 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 
1262 aa  191  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 
670 aa  191  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
828 aa  190  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 
714 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
660 aa  188  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
1134 aa  188  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
838 aa  188  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.37 
 
 
1081 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  28.65 
 
 
1258 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
721 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  31.32 
 
 
1187 aa  185  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 
1122 aa  184  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  36.84 
 
 
308 aa  184  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
1021 aa  184  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 
802 aa  184  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
628 aa  184  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  31.17 
 
 
622 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 
622 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
467 aa  184  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  38.99 
 
 
505 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  30.78 
 
 
678 aa  183  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 
1465 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  33.8 
 
 
527 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
470 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  30.47 
 
 
1023 aa  181  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
589 aa  180  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
711 aa  180  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0223  histidine kinase  34.76 
 
 
647 aa  180  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
653 aa  180  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  26.75 
 
 
1258 aa  179  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 
1070 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
969 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
660 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
912 aa  178  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 
1070 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
1432 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1247 aa  177  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
683 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  38.52 
 
 
445 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
640 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
867 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
712 aa  175  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  40.59 
 
 
611 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
871 aa  175  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 
893 aa  175  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 
853 aa  174  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  31.2 
 
 
787 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
611 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
611 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  32.75 
 
 
912 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
641 aa  174  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
642 aa  174  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
622 aa  173  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 
759 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
776 aa  173  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 
1021 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 
630 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
713 aa  172  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 
594 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 
981 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 
814 aa  172  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.04 
 
 
873 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
867 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>