More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5165 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5165  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
593 aa  1192    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0223  histidine kinase  46.42 
 
 
647 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6695  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 
449 aa  343  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
467 aa  323  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  37.58 
 
 
505 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
467 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 
758 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 
688 aa  243  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4350  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
686 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5744  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
510 aa  231  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4373  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
687 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0865062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4217  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
686 aa  230  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4367  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 
800 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.522603  normal  0.113968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
990 aa  223  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 
823 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4824  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
431 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 
819 aa  207  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.63 
 
 
819 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
848 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
614 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
801 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4552  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  52.31 
 
 
624 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1010  putative response regulator  46.9 
 
 
628 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
850 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
850 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4551  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  52.41 
 
 
757 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11855  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
804 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
431 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
644 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1771  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 
923 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4047  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
431 aa  184  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  31.26 
 
 
445 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  32.75 
 
 
737 aa  182  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6104  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  52.72 
 
 
755 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.53 
 
 
711 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1970  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
602 aa  178  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316288  normal  0.365319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
844 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.21 
 
 
1258 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.39 
 
 
553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.92854 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
1262 aa  174  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.95 
 
 
952 aa  174  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
1465 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1247 aa  173  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  30.93 
 
 
1258 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  30.6 
 
 
1379 aa  172  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
842 aa  171  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  31.35 
 
 
1092 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.15 
 
 
799 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0822  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
427 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.165744 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6621  histidine kinase  31.86 
 
 
552 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
1275 aa  167  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
571 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 
571 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0329  hypothetical protein  45.56 
 
 
740 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
845 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2610  histidine kinase  28.92 
 
 
552 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
720 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0352  hypothetical protein  44.32 
 
 
507 aa  157  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3910  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
850 aa  156  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.302032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3002  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
1234 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  28.36 
 
 
558 aa  156  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 
721 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  34.7 
 
 
1278 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 
1342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2731  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
1007 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 
584 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  32.48 
 
 
912 aa  154  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 
695 aa  154  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
642 aa  154  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
946 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
899 aa  153  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
1176 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 
1419 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 
575 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
943 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3901  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
661 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0390399  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
408 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
630 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
1146 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
769 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
991 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 
951 aa  151  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2172  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
658 aa  151  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
727 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
566 aa  150  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  38.26 
 
 
578 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 
691 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 
1426 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
944 aa  150  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
637 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  37.25 
 
 
578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  32.13 
 
 
638 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 
1132 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 
733 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3111  sensory box histidine kinase  31.93 
 
 
423 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.019274  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
931 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  32.7 
 
 
632 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.26 
 
 
1148 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1908  histidine kinase  30.71 
 
 
772 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0199543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>