More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6695 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6695  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
449 aa  901    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5165  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  45.05 
 
 
593 aa  333  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0223  histidine kinase  39.51 
 
 
647 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
467 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  31.83 
 
 
505 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4551  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  52.75 
 
 
757 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11855  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  43.98 
 
 
758 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.77 
 
 
711 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4552  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  51.34 
 
 
624 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4824  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 
431 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1010  putative response regulator  37.86 
 
 
628 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.56 
 
 
553 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.92854 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6104  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  48.62 
 
 
755 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4047  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
431 aa  180  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.81 
 
 
799 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0822  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  51.69 
 
 
427 aa  176  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.165744 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0329  hypothetical protein  43.78 
 
 
740 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 
431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0352  hypothetical protein  43.78 
 
 
507 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3901  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.23 
 
 
814 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0715  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.22 
 
 
297 aa  134  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.731996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
688 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
470 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  25.06 
 
 
445 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4350  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 
686 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5744  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 
510 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4373  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
687 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0865062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4217  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 
686 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 
614 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
417 aa  96.7  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 
850 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
848 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5521  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
524 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  34.73 
 
 
482 aa  94  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
990 aa  93.6  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
850 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4367  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
800 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.522603  normal  0.113968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3028  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 
297 aa  89.7  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3026  response regulator receiver protein  28 
 
 
217 aa  87.8  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1815  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
583 aa  87.4  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
611 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
611 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
823 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  29.01 
 
 
611 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3259  sensor histidine kinase  25.5 
 
 
598 aa  82.4  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  27.04 
 
 
917 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  28.28 
 
 
1278 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  22.55 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  23.75 
 
 
730 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 
644 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
602 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 
683 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  31.72 
 
 
1811 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
1146 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
679 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
396 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
594 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  27.17 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
714 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  24.5 
 
 
715 aa  77.4  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.15 
 
 
1808 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0672  histidine kinase  27.65 
 
 
373 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0967  sensor histidine kinase  30.29 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.54 
 
 
845 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  27.71 
 
 
627 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  27.71 
 
 
627 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  27.71 
 
 
627 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  27.71 
 
 
627 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1250  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  27.41 
 
 
506 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112207 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  27.71 
 
 
627 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  26.46 
 
 
1379 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  27.71 
 
 
627 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  21.62 
 
 
708 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.03 
 
 
1901 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
553 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0672  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  26.43 
 
 
627 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 
431 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  25.7 
 
 
1850 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.92 
 
 
1465 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  27.21 
 
 
737 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 
919 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
589 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  22.91 
 
 
724 aa  73.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2474  histidine kinase  27.56 
 
 
559 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.369133 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  19.66 
 
 
785 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  24.13 
 
 
310 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
552 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
707 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0913  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  24.04 
 
 
544 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
678 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1771  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
923 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  26.49 
 
 
611 aa  71.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>