277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0715 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0715  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 297 aa  616  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.731996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  49.12 
 
 		 467 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 		 553 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.92854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0822  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.32 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4047  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.47 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  51.33 
 
 		 505 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4824  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1010  putative response regulator  47.8 
 
 		 628 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  51.33 
 
 		 467 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 		 758 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4552  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  48.37 
 
 		 624 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4048  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 		 431 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4551  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.86 
 
 		 757 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6104  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.03 
 
 		 755 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.95 
 
 		 799 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.67 
 
 		 711 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0329  hypothetical protein  47.68 
 
 		 740 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0352  hypothetical protein  42.77 
 
 		 507 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6695  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5165  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 		 593 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0223  histidine kinase  40.12 
 
 		 647 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3901  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42 
 
 		 814 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  35.22 
 
 		 482 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3026  response regulator receiver protein  34.9 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5521  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 524 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3028  putative PAS/PAC sensor protein  33.77 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1531  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0782  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 769 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 216 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  34.72 
 
 		 212 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  26.43 
 
 		 216 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 		 976 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  38.81 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2092  response regulator receiver protein  25.96 
 
 		 129 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.18 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 227 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 		 846 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  32.91 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  44.07 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.57 
 
 		 227 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 119 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 208 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 220 aa  49.3  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 237 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 237 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 224 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.46 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  25.69 
 
 		 178 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  25.69 
 
 		 178 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.94 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1348  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  40.48 
 
 		 763 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  25 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 556 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 175 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.48 
 
 		 1692 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.11 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.23 
 
 		 812 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  34.85 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1240  two component LuxR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.28 
 
 		 981 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.01 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 1326 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.04 
 
 		 201 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.4 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  24.67 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2786  two component LuxR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0443035  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 217 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  25.56 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  27.45 
 
 		 376 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 218 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 763 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 221 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>