More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3555 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  100 
 
 		 176 aa  352  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  86.93 
 
 		 175 aa  303  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  85.8 
 
 		 178 aa  301  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  85.8 
 
 		 178 aa  301  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  45.33 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  45.33 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 956 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  49.21 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 950 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  45.07 
 
 		 222 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1093  response regulator  46.15 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.120555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.02 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  30.51 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  53.57 
 
 		 924 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  53.57 
 
 		 901 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.2 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  30.51 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 917 aa  60.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  47.76 
 
 		 913 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1080  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  54.55 
 
 		 823 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  46.15 
 
 		 90 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  51.79 
 
 		 904 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  34.51 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  44.62 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3768  LuxR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.49 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  50.94 
 
 		 884 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.24 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  40 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  34.65 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  34.65 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  34.65 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  34.65 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  54.24 
 
 		 894 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1980  two component LuxR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.893627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.64 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 856 aa  58.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  47.62 
 
 		 916 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  34.29 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25620  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.15 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0864  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  46.03 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3302  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  58.82 
 
 		 903 aa  58.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  48.48 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 910 aa  58.2  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.78 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  47.46 
 
 		 337 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  48.28 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 959 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3194  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0232917  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  47.69 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2085  DNA-binding response regulator  50.94 
 
 		 264 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.844485  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0851  DNA-binding response regulator  50.94 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464733  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 952 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 218 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3500  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 249 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 218 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2062  LuxR family DNA-binding response regulator  50.94 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0766  DNA-binding response regulator  50.94 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  37.11 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>