More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1027 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  82.43 
 
 		 222 aa  363  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 288 aa  158  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 273 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 264 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3294  LysR-family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42203  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3468  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 248 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0530935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3373  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 227 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3366  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.857101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3299  LysR-family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3378  LuxR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.394495  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0596  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0228  LuxR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7042  LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2822  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4059  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3567  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1314  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  44.12 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1738  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  45.45 
 
 		 904 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1286  two component LuxR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2246  two component LuxR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0703025  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4816  response regulator receiver protein  50 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.890736  normal  0.794324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.74 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  44.64 
 
 		 839 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3420  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  51.92 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4608  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 275 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  51.92 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  51.92 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  51.92 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1159  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  51.92 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1419  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  51.92 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1766  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00488071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1828  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  42.11 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  51.92 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.353555  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  51.92 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  33.66 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01037  DNA-binding transcriptional activator in two-component regulatory system  51.92 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1813  two component LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 249 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0675  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 319 aa  52  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.010777 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1158  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  51.92 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.354651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2559  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  51.92 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.980478  normal  0.382247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0756  LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3704  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0339608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01044  hypothetical protein  51.92 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4341  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 343 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 		 876 aa  52  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>