More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1273 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
273 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  99.63 
 
 
273 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  99.63 
 
 
273 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  99.23 
 
 
259 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  99.57 
 
 
235 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  89.81 
 
 
288 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  99.57 
 
 
235 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  68.91 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  64.66 
 
 
246 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  68.88 
 
 
242 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  68.88 
 
 
251 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  68.88 
 
 
251 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  67.08 
 
 
243 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
243 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 
222 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  43.66 
 
 
222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3366  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.857101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3299  LysR-family transcriptional regulator  35.89 
 
 
227 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212015  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3373  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3468  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0530935  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3294  LysR-family transcriptional regulator  35.41 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42203  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
215 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
224 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7042  LuxR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  27.78 
 
 
279 aa  62.4  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  27.69 
 
 
247 aa  62.4  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  25.77 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 
876 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.85 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 
865 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.63 
 
 
881 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0669  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  27.31 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
119 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
209 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  24.22 
 
 
284 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4851  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  37.82 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0743346  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01037  DNA-binding transcriptional activator in two-component regulatory system  50.91 
 
 
216 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01044  hypothetical protein  50.91 
 
 
216 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50.94 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
227 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50.94 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
209 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  27.13 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1158  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50.94 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.354651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50.94 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1419  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50.94 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.132272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2559  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50.94 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.980478  normal  0.382247 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50.94 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
227 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50.94 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4109  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  34.35 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.721487  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50.94 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1159  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50.94 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1556  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  50.94 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  47.17 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1813  two component LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  54 
 
 
235 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2046  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50 
 
 
198 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
198 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  45.45 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1738  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 
219 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.949758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  45.31 
 
 
207 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 
222 aa  56.6  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1358  two component LuxR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110964  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 
903 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  47.17 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  45.45 
 
 
210 aa  56.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
209 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
209 aa  55.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
213 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 
212 aa  55.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2570  two component LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 
224 aa  55.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 
213 aa  55.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  50 
 
 
212 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6781  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 
232 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
910 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
894 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3632  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 
209 aa  55.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00835522  normal  0.0174868 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0859  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3002  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000242381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 
1089 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  40.23 
 
 
218 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
215 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 
905 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>