More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1879 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  100 
 
 		 839 aa  1706    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1080  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  31.35 
 
 		 823 aa  356  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2065  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  27.85 
 
 		 838 aa  263  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0621  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  24.67 
 
 		 824 aa  204  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000506024  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  29.33 
 
 		 900 aa  75.5  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.09 
 
 		 896 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  28.69 
 
 		 914 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  27.32 
 
 		 907 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 907 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 906 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  27.61 
 
 		 960 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.36 
 
 		 1021 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  32.04 
 
 		 824 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.64 
 
 		 910 aa  68.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  28.2 
 
 		 910 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  28.23 
 
 		 907 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.5 
 
 		 867 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.8 
 
 		 884 aa  65.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.98 
 
 		 911 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  34.85 
 
 		 855 aa  65.1  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 906 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25 
 
 		 897 aa  64.7  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  23.1 
 
 		 903 aa  64.3  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  23.1 
 
 		 903 aa  64.3  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  27.04 
 
 		 920 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.32 
 
 		 947 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.15 
 
 		 1019 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.09 
 
 		 880 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 		 213 aa  62.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.41 
 
 		 905 aa  61.6  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  25.41 
 
 		 717 aa  61.6  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  28.12 
 
 		 905 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  23.93 
 
 		 904 aa  61.2  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.41 
 
 		 905 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  24.46 
 
 		 901 aa  60.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.29 
 
 		 860 aa  60.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 905 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  25.64 
 
 		 894 aa  60.1  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 876 aa  59.7  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.7 
 
 		 924 aa  58.9  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 959 aa  58.9  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 879 aa  58.9  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  24.44 
 
 		 901 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  24.47 
 
 		 902 aa  58.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  24.47 
 
 		 902 aa  58.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  24.44 
 
 		 901 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  24.66 
 
 		 732 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  24.44 
 
 		 901 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.44 
 
 		 901 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.38 
 
 		 922 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  24.44 
 
 		 901 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.25 
 
 		 925 aa  58.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  56.6 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  24.44 
 
 		 901 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  24.44 
 
 		 901 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  24.44 
 
 		 901 aa  58.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  23.76 
 
 		 887 aa  57.8  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  24.03 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  32.54 
 
 		 917 aa  57.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1093  transcriptional regulator, LuxR family  31.69 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.569375  hitchhiker  0.0000000000000377381 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13550  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.9 
 
 		 506 aa  57.4  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  57.4  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  33.77 
 
 		 879 aa  57  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.29 
 
 		 905 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2779  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 505 aa  57.4  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.980405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1493  transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 198 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.3 
 
 		 203 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 416 aa  56.6  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  44.74 
 
 		 222 aa  57  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  44.21 
 
 		 516 aa  56.6  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  26.87 
 
 		 756 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 218 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  43.86 
 
 		 917 aa  55.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 956 aa  56.2  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 216 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1485  transcriptional regulator, LuxR family  41.77 
 
 		 952 aa  55.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  25 
 
 		 1111 aa  55.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 221 aa  55.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  48.98 
 
 		 221 aa  55.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.33 
 
 		 505 aa  55.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  54.17 
 
 		 1003 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  54 
 
 		 218 aa  55.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 258 aa  55.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  26.39 
 
 		 900 aa  55.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2146  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 277 aa  55.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.208263  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 313 aa  55.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  55.1 
 
 		 896 aa  54.7  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  27.97 
 
 		 904 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 893 aa  54.7  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 175 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 		 191 aa  54.7  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 214 aa  54.3  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  29.38 
 
 		 911 aa  54.3  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  43.4 
 
 		 356 aa  54.7  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 178 aa  54.7  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 178 aa  54.7  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4082  regulatory protein, LuxR  36.07 
 
 		 888 aa  54.3  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.566011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 218 aa  54.3  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  34.48 
 
 		 933 aa  54.3  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>