More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3139 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 879 aa  1679    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 864 aa  281  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  32.68 
 
 		 880 aa  268  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  32.88 
 
 		 884 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 884 aa  261  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  33.53 
 
 		 865 aa  253  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  32.98 
 
 		 867 aa  251  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  30.8 
 
 		 868 aa  213  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 871 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  33.12 
 
 		 562 aa  159  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  30.96 
 
 		 903 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 893 aa  111  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 1001 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  28.96 
 
 		 908 aa  105  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 894 aa  99.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 907 aa  99  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  42.58 
 
 		 660 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4009  ATPas  44.37 
 
 		 690 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4083  AAA ATPase  44.37 
 
 		 690 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0947323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4239  AAA ATPase  44.37 
 
 		 690 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  27.96 
 
 		 845 aa  88.6  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4512  ATPas  40.67 
 
 		 640 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360294  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.24 
 
 		 881 aa  80.1  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  28.1 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 910 aa  72  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 950 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  36.94 
 
 		 876 aa  68.6  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1823  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 846 aa  67.8  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  61.54 
 
 		 959 aa  67  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 882 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  56.67 
 
 		 929 aa  64.3  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  34.78 
 
 		 925 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  62.5 
 
 		 956 aa  62.4  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  60.66 
 
 		 940 aa  61.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 912 aa  61.6  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 775 aa  60.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  56.36 
 
 		 827 aa  59.7  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  39.55 
 
 		 946 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.41 
 
 		 222 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.84 
 
 		 998 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 895 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  52.73 
 
 		 934 aa  59.7  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  52.73 
 
 		 839 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  66.67 
 
 		 907 aa  59.3  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 1085 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.46 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1460  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.659068  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 937 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  51.85 
 
 		 937 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  51.85 
 
 		 937 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 		 904 aa  58.9  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 894 aa  58.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 959 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 926 aa  58.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  61.11 
 
 		 963 aa  58.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 1137 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 889 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  54.55 
 
 		 900 aa  58.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  62 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  39.39 
 
 		 923 aa  57.8  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 905 aa  58.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 265 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 877 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 951 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 224 aa  57.4  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 903 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 272 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 920 aa  57.4  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4918  metal-dependent phosphohydrolase  57.14 
 
 		 516 aa  57.4  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.401687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 258 aa  57  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  50.94 
 
 		 940 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  55.77 
 
 		 1085 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.49 
 
 		 218 aa  57.4  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.48 
 
 		 230 aa  57  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 909 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.03 
 
 		 215 aa  56.2  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 223 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  55.1 
 
 		 956 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 275 aa  56.6  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  36.55 
 
 		 960 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 268 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0244  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 216 aa  56.2  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 160 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  48.15 
 
 		 930 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 947 aa  56.2  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 262 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 927 aa  57  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 998 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.04 
 
 		 221 aa  56.6  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.21 
 
 		 309 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  56 
 
 		 204 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  56 
 
 		 204 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  58 
 
 		 213 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 235 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 266 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  52.73 
 
 		 936 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  50.88 
 
 		 929 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>