More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1485 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1485  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
952 aa  1778    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  35.65 
 
 
937 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  34.89 
 
 
973 aa  271  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  35.38 
 
 
963 aa  270  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  34.44 
 
 
963 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  35.73 
 
 
957 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  33.51 
 
 
1118 aa  97.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  28.01 
 
 
1837 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.48 
 
 
1134 aa  86.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.61 
 
 
1081 aa  85.5  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
895 aa  84.3  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  24.5 
 
 
881 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.77 
 
 
1403 aa  83.2  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  32.4 
 
 
1013 aa  82.4  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27 
 
 
1005 aa  81.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  29.27 
 
 
1126 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.2 
 
 
1080 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  26.45 
 
 
1739 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.55 
 
 
1666 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  22.31 
 
 
1826 aa  78.6  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  29.79 
 
 
1123 aa  77.4  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
973 aa  76.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.1 
 
 
1055 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.23 
 
 
852 aa  76.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  29.03 
 
 
1020 aa  75.5  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.16 
 
 
1089 aa  75.5  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.81 
 
 
1175 aa  74.7  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 
952 aa  74.7  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  28.3 
 
 
1139 aa  74.3  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  26.23 
 
 
1710 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0208  Tetratricopeptide TPR_4  31.77 
 
 
1042 aa  72.8  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26.43 
 
 
1048 aa  72.8  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.42 
 
 
1780 aa  72.4  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  31.52 
 
 
900 aa  72  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.85 
 
 
1160 aa  72  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  26.03 
 
 
1227 aa  71.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.57 
 
 
1150 aa  71.2  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  30.58 
 
 
1353 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  25 
 
 
1922 aa  71.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.92 
 
 
1023 aa  71.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  25.75 
 
 
1836 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  29.37 
 
 
1123 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.77 
 
 
1663 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.62 
 
 
1053 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 
901 aa  69.3  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  20.52 
 
 
1914 aa  69.3  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
1402 aa  68.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  19.95 
 
 
1774 aa  69.3  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 
1311 aa  68.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.1 
 
 
1468 aa  67.8  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.82 
 
 
1149 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  30.25 
 
 
1071 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.02 
 
 
1291 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 
1105 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.57 
 
 
1845 aa  67  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  25.94 
 
 
1183 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.05 
 
 
1122 aa  66.6  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  27.7 
 
 
1114 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  28.83 
 
 
723 aa  66.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 
925 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 
923 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  21.82 
 
 
1908 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
1063 aa  65.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.4 
 
 
1668 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  27.18 
 
 
1264 aa  65.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  27.71 
 
 
1682 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.62 
 
 
923 aa  65.5  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  26.49 
 
 
1833 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 
1398 aa  65.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  29.83 
 
 
1682 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  30.75 
 
 
927 aa  64.7  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  30.97 
 
 
1121 aa  64.7  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  29.69 
 
 
1151 aa  64.7  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  30.25 
 
 
1118 aa  64.7  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  27.79 
 
 
1788 aa  64.7  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.09 
 
 
1146 aa  64.7  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  25.83 
 
 
1685 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
1235 aa  64.3  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  25.83 
 
 
1774 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  27.17 
 
 
1037 aa  64.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  31 
 
 
1422 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  26.68 
 
 
1046 aa  64.3  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  25.42 
 
 
1055 aa  64.3  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.87 
 
 
1117 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  26.49 
 
 
1885 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  33.24 
 
 
1161 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  29.48 
 
 
1198 aa  63.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26.82 
 
 
1141 aa  63.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 
1403 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  28.84 
 
 
1685 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  28.95 
 
 
1685 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.78 
 
 
1006 aa  63.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26.82 
 
 
1141 aa  63.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  29.16 
 
 
1163 aa  62.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  29.31 
 
 
914 aa  62.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 
946 aa  62.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  29.39 
 
 
1153 aa  62.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  30.21 
 
 
872 aa  62.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.61 
 
 
967 aa  62.4  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  26.96 
 
 
1138 aa  62.4  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>