44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0208 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0208  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 1042 aa  2034    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.25 
 
 		 868 aa  64.7  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.84 
 
 		 1080 aa  63.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  25.41 
 
 		 864 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 919 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  24.91 
 
 		 919 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.45 
 
 		 1081 aa  58.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.39 
 
 		 782 aa  58.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  24.91 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.95 
 
 		 609 aa  57.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 1216 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  27.56 
 
 		 1118 aa  55.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  26.18 
 
 		 1122 aa  54.7  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1101 aa  54.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  27.95 
 
 		 1198 aa  54.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.86 
 
 		 1424 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 		 1142 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 1063 aa  52  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  25.56 
 
 		 1007 aa  51.6  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  23.73 
 
 		 1160 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  31.23 
 
 		 1013 aa  51.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  26.1 
 
 		 725 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.6 
 
 		 1151 aa  50.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.43 
 
 		 1403 aa  50.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  28.21 
 
 		 1151 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  25.51 
 
 		 1094 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 1198 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  28.02 
 
 		 913 aa  48.9  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  26.96 
 
 		 901 aa  48.5  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  36.47 
 
 		 1083 aa  48.5  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.96 
 
 		 1089 aa  48.5  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  31.3 
 
 		 900 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  26.27 
 
 		 998 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.19 
 
 		 1148 aa  47.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  24.86 
 
 		 816 aa  47.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.41 
 
 		 1055 aa  46.2  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  30.67 
 
 		 957 aa  45.8  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 975 aa  45.8  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  24.64 
 
 		 1914 aa  45.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  25.55 
 
 		 916 aa  45.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 1714 aa  45.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.72 
 
 		 1429 aa  45.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1162 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  24.41 
 
 		 1161 aa  44.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>