More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4065 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  100 
 
 		 864 aa  1710    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  59.44 
 
 		 880 aa  922    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  46.35 
 
 		 867 aa  601  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  40.05 
 
 		 865 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  38.02 
 
 		 884 aa  419  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  35.62 
 
 		 884 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  33.81 
 
 		 562 aa  243  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 879 aa  239  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  30.8 
 
 		 868 aa  232  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4009  ATPas  32.52 
 
 		 690 aa  231  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4083  AAA ATPase  32.52 
 
 		 690 aa  231  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0947323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4239  AAA ATPase  32.52 
 
 		 690 aa  230  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4512  ATPas  31.15 
 
 		 640 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360294  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  31.06 
 
 		 660 aa  145  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  28.2 
 
 		 1001 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 894 aa  118  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  29.74 
 
 		 871 aa  118  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  29.34 
 
 		 893 aa  114  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 926 aa  111  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  26.44 
 
 		 845 aa  100  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  28.23 
 
 		 912 aa  100  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 910 aa  96.3  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  31.25 
 
 		 292 aa  93.6  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  30.8 
 
 		 903 aa  90.1  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  26.38 
 
 		 908 aa  85.5  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 907 aa  83.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  26.55 
 
 		 893 aa  67.8  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  27.11 
 
 		 966 aa  65.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 814 aa  64.7  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  60 
 
 		 862 aa  62.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 895 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  27.81 
 
 		 901 aa  62.4  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  47.5 
 
 		 919 aa  62.4  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 217 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  62.26 
 
 		 907 aa  59.7  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  25.92 
 
 		 1143 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0208  Tetratricopeptide TPR_4  25.41 
 
 		 1042 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  49.09 
 
 		 923 aa  58.9  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03493  hypothetical protein  51.79 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  59.26 
 
 		 884 aa  58.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 		 938 aa  58.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  61.82 
 
 		 981 aa  58.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  28.32 
 
 		 1071 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 213 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.09 
 
 		 881 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11227  hypothetical protein  32.16 
 
 		 194 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 889 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 928 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  45.98 
 
 		 998 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.41 
 
 		 229 aa  56.6  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 206 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.34 
 
 		 1029 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 946 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 235 aa  55.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 775 aa  55.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 214 aa  55.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0244  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.45 
 
 		 216 aa  55.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  49.12 
 
 		 799 aa  55.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  55.36 
 
 		 1089 aa  55.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  22.75 
 
 		 1134 aa  55.1  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.85 
 
 		 247 aa  55.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00793239  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  52.24 
 
 		 886 aa  55.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 217 aa  55.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  33.83 
 
 		 956 aa  55.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3683  two component LuxR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 205 aa  54.7  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00690698  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  47.54 
 
 		 1006 aa  54.7  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 226 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  42.42 
 
 		 900 aa  54.7  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3602  LuxR response regulator receiver  54.55 
 
 		 206 aa  54.7  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.66617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 229 aa  54.7  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2779  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 505 aa  54.7  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.980405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 203 aa  54.3  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 		 894 aa  54.3  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4855  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 244 aa  54.3  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.093919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  38.61 
 
 		 961 aa  54.3  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 865 aa  54.3  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 940 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  45.21 
 
 		 230 aa  53.9  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 230 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  56.25 
 
 		 963 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  54.72 
 
 		 951 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.75 
 
 		 211 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  52.83 
 
 		 776 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 209 aa  54.3  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  50.85 
 
 		 792 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 207 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 222 aa  54.3  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 929 aa  53.9  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  34.68 
 
 		 220 aa  53.9  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  45.76 
 
 		 222 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34130  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.93 
 
 		 853 aa  53.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 1151 aa  53.5  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.2 
 
 		 200 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 		 244 aa  53.5  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  54 
 
 		 219 aa  53.5  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.76 
 
 		 1403 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.1 
 
 		 222 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 952 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>