More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0258 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 200 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  67 
 
 		 200 aa  241  6e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 198 aa  238  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  65.5 
 
 		 200 aa  231  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  55 
 
 		 200 aa  228  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  55.5 
 
 		 200 aa  227  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  57 
 
 		 202 aa  227  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  55.5 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 205 aa  225  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  54.5 
 
 		 200 aa  224  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  54 
 
 		 200 aa  222  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  54.5 
 
 		 200 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  54.5 
 
 		 200 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  54.5 
 
 		 200 aa  222  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  54.5 
 
 		 200 aa  221  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  54.5 
 
 		 200 aa  221  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  54 
 
 		 200 aa  221  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  56.78 
 
 		 198 aa  221  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.71 
 
 		 201 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  56.65 
 
 		 202 aa  208  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 198 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 198 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 198 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.78 
 
 		 198 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  55.28 
 
 		 198 aa  204  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 198 aa  204  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 198 aa  204  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 198 aa  203  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.27 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  54.81 
 
 		 207 aa  201  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  53.23 
 
 		 197 aa  201  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  49.75 
 
 		 197 aa  191  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  53 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.74 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.25 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  52.97 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.24 
 
 		 201 aa  185  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.5 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  53.96 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.55 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.5 
 
 		 203 aa  181  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.75 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  45.45 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.98 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.25 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.5 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.75 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2610  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.81 
 
 		 144 aa  175  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000438854  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  48.76 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.26 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.76 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.77 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  48.02 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  48.02 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.76 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.52 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  39.5 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.15 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  42.21 
 
 		 200 aa  161  7e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  46.53 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.04 
 
 		 201 aa  157  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.5 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  35.5 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.5 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  44.28 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  44.28 
 
 		 227 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 190 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.27 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 218 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.06 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  47.26 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.5 
 
 		 204 aa  147  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 223 aa  141  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.26 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  37.93 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.91 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.9 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.1 
 
 		 215 aa  137  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.49 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.65 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>