More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0286 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 203 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  69 
 
 		 204 aa  270  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.5 
 
 		 201 aa  248  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  65 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  67 
 
 		 201 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  68 
 
 		 200 aa  240  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.5 
 
 		 201 aa  239  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  65.5 
 
 		 201 aa  238  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  64.5 
 
 		 201 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 212 aa  234  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.4 
 
 		 223 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  62.19 
 
 		 197 aa  228  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  60 
 
 		 201 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  64.5 
 
 		 224 aa  224  7e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  56.5 
 
 		 197 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.73 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  61.81 
 
 		 201 aa  214  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.5 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  57 
 
 		 201 aa  207  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.45 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.38 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  55 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  52.45 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.5 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.77 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  54 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  52.74 
 
 		 202 aa  191  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.74 
 
 		 202 aa  191  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.91 
 
 		 206 aa  187  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 		 200 aa  187  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  49.27 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 190 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 200 aa  186  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  43 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 		 200 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.5 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  51.5 
 
 		 201 aa  184  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  42.5 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  51 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50.74 
 
 		 203 aa  181  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  56 
 
 		 200 aa  174  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.5 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.5 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 200 aa  168  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  49 
 
 		 204 aa  167  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.31 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  45.27 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  51.5 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  42.71 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  45.24 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  43.63 
 
 		 202 aa  161  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  35.89 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 217 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  45 
 
 		 201 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  40.47 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2610  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.79 
 
 		 144 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000438854  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 223 aa  134  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.12 
 
 		 211 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3614  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.765091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 222 aa  131  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.36 
 
 		 230 aa  131  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  33 
 
 		 200 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1820  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.42 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  normal  0.0923177 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  40.18 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4244  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0412084 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>