More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11510 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  100 
 
 		 203 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  68 
 
 		 200 aa  264  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.5 
 
 		 202 aa  238  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  65.5 
 
 		 200 aa  238  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  57 
 
 		 197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.85 
 
 		 204 aa  211  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.72 
 
 		 201 aa  208  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  56 
 
 		 200 aa  201  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  52 
 
 		 197 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  51.23 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.2 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.25 
 
 		 200 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.75 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.5 
 
 		 205 aa  184  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 203 aa  177  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.74 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  44.28 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.74 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.53 
 
 		 204 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  51.74 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.31 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  49.25 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.18 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.77 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.04 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  46.77 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.5 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  46.8 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 200 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  47.29 
 
 		 201 aa  158  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.81 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  46.31 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.08 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 198 aa  148  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 198 aa  147  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  38.69 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  39.71 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.5 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  32.34 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 190 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1561  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  37.8 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.89 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.73 
 
 		 224 aa  123  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  31.34 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 216 aa  121  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  34.74 
 
 		 595 aa  121  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 215 aa  120  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 595 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 223 aa  121  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  34.27 
 
 		 595 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  36.2 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>