More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03860 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  100 
 
 		 204 aa  398  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  74.37 
 
 		 201 aa  286  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  73 
 
 		 201 aa  283  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  73 
 
 		 201 aa  280  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.83 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  72.5 
 
 		 201 aa  256  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  60 
 
 		 197 aa  225  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  58 
 
 		 197 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.19 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  58 
 
 		 201 aa  211  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  54.85 
 
 		 203 aa  211  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  53.5 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.5 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.45 
 
 		 203 aa  197  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.41 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  52.5 
 
 		 201 aa  191  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.96 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.5 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  53 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  51.5 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 212 aa  187  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.5 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  49 
 
 		 205 aa  184  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  54 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  50.75 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.5 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.5 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  51 
 
 		 202 aa  181  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  54 
 
 		 200 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  49.75 
 
 		 204 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  49 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.5 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 200 aa  174  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.19 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.5 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.5 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.11 
 
 		 190 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  41.5 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  41.5 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  41 
 
 		 200 aa  167  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  41 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  41 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  41 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  41 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  41 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.5 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  45.5 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.74 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 198 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  49 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 202 aa  154  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  37.69 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  41 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  38.42 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  41 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03380  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  60.98 
 
 		 153 aa  141  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.55 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.26 
 
 		 221 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  39.71 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6814  response regulator receiver protein  54.14 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  36.89 
 
 		 595 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  41.5 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  36.89 
 
 		 595 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  35.92 
 
 		 592 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 595 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  40.19 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.67 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.02 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3789  response regulator receiver  36.7 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1676  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 		 228 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4035  two component LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>