More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0528 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  73.63 
 
 		 201 aa  281  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  73 
 
 		 204 aa  280  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  75.12 
 
 		 201 aa  263  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.15 
 
 		 201 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.05 
 
 		 206 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  56.72 
 
 		 201 aa  226  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  58.21 
 
 		 197 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  58.21 
 
 		 197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.2 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.5 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.23 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  59 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  54.19 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  58.21 
 
 		 201 aa  201  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  57 
 
 		 203 aa  201  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 201 aa  197  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.21 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.22 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.22 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.5 
 
 		 212 aa  194  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.5 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.22 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  55.72 
 
 		 200 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  56.5 
 
 		 205 aa  191  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  53.47 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.76 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.24 
 
 		 200 aa  187  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.29 
 
 		 211 aa  187  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  52.74 
 
 		 227 aa  186  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  50.5 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.5 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  51.74 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.25 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  51.74 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.71 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.96 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.11 
 
 		 190 aa  174  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  49 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  44.28 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  44.28 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.76 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  44.28 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  44.28 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.02 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.28 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6814  response regulator receiver protein  65.47 
 
 		 159 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.99 
 
 		 201 aa  167  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  51.74 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.5 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  38.19 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.44 
 
 		 215 aa  137  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  41.5 
 
 		 198 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  42.18 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  38.73 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  41.63 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.5 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3696  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 230 aa  134  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  41.31 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.47 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3614  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.765091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.5 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  127  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0855  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.082304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  31.34 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>