More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3654 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 201 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  62.19 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  58.42 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.22 
 
 		 201 aa  214  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  55.45 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  53.73 
 
 		 227 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  53.73 
 
 		 201 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  53.73 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.5 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.68 
 
 		 190 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.25 
 
 		 201 aa  184  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  48.76 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  55.5 
 
 		 205 aa  184  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.74 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  50.75 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.75 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  49.75 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.01 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  47.76 
 
 		 197 aa  175  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 200 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  44.28 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.5 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.76 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.76 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.5 
 
 		 224 aa  161  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 205 aa  161  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.75 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 208 aa  160  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.76 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.18 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.5 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.06 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  38.69 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 206 aa  148  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.26 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.28 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.31 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  48.26 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  38 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  35.32 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  32.84 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3614  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.765091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  38 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  37.25 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  38.46 
 
 		 207 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 224 aa  124  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 595 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0536  transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.27 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  33.18 
 
 		 595 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.81 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.31 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  32.7 
 
 		 595 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  32.7 
 
 		 592 aa  121  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  33.8 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  33.8 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4244  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0412084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.82 
 
 		 225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4035  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>