More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4055 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  100 
 
 		 201 aa  390  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  84.58 
 
 		 201 aa  316  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.5 
 
 		 212 aa  280  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.15 
 
 		 208 aa  261  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.16 
 
 		 201 aa  258  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.66 
 
 		 201 aa  247  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.5 
 
 		 204 aa  245  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.5 
 
 		 203 aa  244  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  70 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.67 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  60.2 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.19 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.69 
 
 		 200 aa  225  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  58.71 
 
 		 197 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  57.21 
 
 		 227 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  57.92 
 
 		 202 aa  214  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  59 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  55.22 
 
 		 197 aa  212  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  57.21 
 
 		 201 aa  211  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  55.94 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.22 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.73 
 
 		 201 aa  201  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.42 
 
 		 190 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.5 
 
 		 204 aa  201  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  57.71 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.22 
 
 		 201 aa  197  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.74 
 
 		 201 aa  197  7.999999999999999e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.5 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  49 
 
 		 205 aa  194  9e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 200 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.22 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.96 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  47.76 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  47.76 
 
 		 200 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  51.74 
 
 		 201 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  48.26 
 
 		 200 aa  191  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.34 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.75 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.26 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 200 aa  184  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 202 aa  184  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.25 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  48.53 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  47.89 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  48 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.77 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.5 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.5 
 
 		 204 aa  168  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.77 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.76 
 
 		 200 aa  167  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  43.14 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2610  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.69 
 
 		 144 aa  158  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000438854  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  46.77 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.25 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  46.77 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.28 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  35.32 
 
 		 200 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  36.32 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.52 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4244  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.86 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0412084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1820  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  normal  0.0923177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  41.4 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.61 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  39.55 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3614  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.78 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.765091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>