More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06340 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  100 
 
 		 211 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.62 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.61 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.76 
 
 		 201 aa  194  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  48.34 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  49.29 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.66 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.55 
 
 		 201 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 205 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  50.71 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.97 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.17 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  48.34 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  45.02 
 
 		 197 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  43.13 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  43.6 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 200 aa  178  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  43.13 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 208 aa  177  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.45 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  42.18 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  42.18 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.19 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.97 
 
 		 201 aa  171  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  44.08 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.18 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.76 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 198 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 198 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.29 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.13 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.13 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.02 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 218 aa  155  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.18 
 
 		 201 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  41.71 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.55 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  40.47 
 
 		 202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.2 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.22 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  36.19 
 
 		 200 aa  149  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.36 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  41.36 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  32.7 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  35.89 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.18 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.83 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  38.12 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  38.5 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 234 aa  138  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  32.23 
 
 		 200 aa  138  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.38 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 214 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 216 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.64 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.95 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>