More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0183 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  385  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.5 
 
 		 200 aa  246  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  69 
 
 		 200 aa  234  8e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.78 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 198 aa  215  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  56.78 
 
 		 198 aa  215  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  54 
 
 		 200 aa  214  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  57 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 205 aa  211  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  57 
 
 		 200 aa  211  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  52.5 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.2 
 
 		 201 aa  208  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 200 aa  207  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  52 
 
 		 200 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  52 
 
 		 200 aa  206  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  52 
 
 		 200 aa  206  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  52 
 
 		 200 aa  206  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.71 
 
 		 212 aa  206  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  51.5 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  52 
 
 		 200 aa  205  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  52 
 
 		 200 aa  205  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  51.5 
 
 		 200 aa  205  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  59.2 
 
 		 201 aa  204  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  57.71 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.72 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  57.71 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  55.77 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  56.93 
 
 		 201 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.22 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  54.68 
 
 		 202 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  54.77 
 
 		 198 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  54.77 
 
 		 198 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  54.77 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  54.27 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.27 
 
 		 198 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.95 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.5 
 
 		 205 aa  188  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  53.47 
 
 		 197 aa  187  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 198 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 198 aa  187  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 198 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.21 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  57 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2610  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.75 
 
 		 144 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000438854  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.29 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  51.74 
 
 		 203 aa  184  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  52.97 
 
 		 202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.97 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.24 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.95 
 
 		 200 aa  181  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.74 
 
 		 201 aa  181  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  45.96 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.24 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.74 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.74 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.25 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.26 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.75 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.24 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.5 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  48.76 
 
 		 227 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.26 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  47.76 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.94 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  47.52 
 
 		 204 aa  157  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.73 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  41.75 
 
 		 218 aa  155  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  50.75 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2019  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 223 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  36.5 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 220 aa  151  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4035  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  35.5 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.45 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3789  response regulator receiver  38.68 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1676  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4449  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2401  response regulator receiver  39.15 
 
 		 230 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 222 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 222 aa  141  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  37.91 
 
 		 595 aa  140  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 595 aa  140  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  37.44 
 
 		 595 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>