More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0686 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  56.57 
 
 		 201 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  46.27 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  46.27 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  46.27 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  46.27 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  46.27 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  46.27 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  46.27 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  46 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  44.78 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  45.6 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.78 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  42.21 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1123  Fis family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 207 aa  167  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  42.5 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.27 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.57 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  42.38 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.87 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 218 aa  161  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  39.8 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  44.85 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.96 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  39.8 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 212 aa  154  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  40 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  41.03 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  41.09 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 214 aa  151  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  38.81 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1465  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.1 
 
 		 247 aa  150  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  37.11 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.84 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1484  response regulator  41.58 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  41.54 
 
 		 205 aa  148  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 201 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  37.62 
 
 		 205 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  36.73 
 
 		 205 aa  147  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1521  response regulator  41.05 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1955  response regulator  41.05 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3862  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1500  response regulator  41.05 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000401264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1784  response regulator  41.05 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>