More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3812 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  53.81 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  53.77 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.77 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  49.5 
 
 		 233 aa  192  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.26 
 
 		 230 aa  187  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 224 aa  187  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.25 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.98 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 		 228 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  46.94 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.53 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 214 aa  177  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  47.21 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  48.17 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  44.15 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  46.03 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.13 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 219 aa  168  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  43.56 
 
 		 202 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 208 aa  168  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 208 aa  168  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.28 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.45 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.45 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  43.43 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  44.39 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  43.62 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  41.98 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  47.34 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.59 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  46.39 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  45.23 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.65 
 
 		 223 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  42.55 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  43.92 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  43.08 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  43.94 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 228 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  42.56 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 241 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.15 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>