More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3400 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  59.69 
 
 
198 aa  251  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  57.22 
 
 
202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  57.22 
 
 
202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  55.67 
 
 
202 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  55.38 
 
 
202 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  53.47 
 
 
209 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.53 
 
 
212 aa  201  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  52.76 
 
 
209 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  51.31 
 
 
210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  50.76 
 
 
212 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  47.45 
 
 
207 aa  194  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  48.78 
 
 
208 aa  194  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.26 
 
 
211 aa  194  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
208 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.26 
 
 
211 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  50.48 
 
 
216 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
216 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.53 
 
 
208 aa  191  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  50.25 
 
 
209 aa  191  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  47.26 
 
 
210 aa  186  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  46.35 
 
 
212 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  46.35 
 
 
212 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  46.35 
 
 
212 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  46.35 
 
 
212 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  46.35 
 
 
212 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  46.35 
 
 
212 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  46.35 
 
 
212 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  48.42 
 
 
210 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0209  two component LuxR family transcriptional regulator  49.75 
 
 
225 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  46.35 
 
 
212 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
208 aa  185  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  48.77 
 
 
203 aa  185  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
216 aa  185  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
212 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
212 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
208 aa  184  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
212 aa  184  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
212 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
212 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
212 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  47.4 
 
 
215 aa  184  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
212 aa  184  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3918  two component LuxR family transcriptional regulator  53.19 
 
 
215 aa  184  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  47.18 
 
 
208 aa  184  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.18 
 
 
208 aa  184  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  45.83 
 
 
208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  46.35 
 
 
214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 
210 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  47.4 
 
 
207 aa  181  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
207 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  46.91 
 
 
208 aa  181  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3683  two component LuxR family transcriptional regulator  48.73 
 
 
205 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00690698  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  45.64 
 
 
208 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 
214 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  48.13 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  49.74 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  42.56 
 
 
203 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.11 
 
 
212 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 
207 aa  168  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  46.28 
 
 
214 aa  168  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  41.41 
 
 
231 aa  166  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  46.88 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
208 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  44 
 
 
204 aa  165  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
241 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  48.17 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.78 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  42.57 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  43.08 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
210 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
210 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 
213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  41.36 
 
 
212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  42.05 
 
 
203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  44.1 
 
 
212 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  46.15 
 
 
205 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 
220 aa  160  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
224 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  43.39 
 
 
201 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  43.68 
 
 
208 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  45.99 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  45.99 
 
 
214 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
210 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
210 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
209 aa  158  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  46.5 
 
 
201 aa  157  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  43.01 
 
 
250 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  41.58 
 
 
205 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
203 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  38.95 
 
 
246 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  46.5 
 
 
201 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 
209 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  42.63 
 
 
205 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
214 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>