More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1552 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  53.68 
 
 		 202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1123  Fis family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.12 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  43.15 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  40.21 
 
 		 216 aa  157  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  43.16 
 
 		 209 aa  154  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  45.88 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 210 aa  153  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 250 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 206 aa  151  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  41.21 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  41.24 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.41 
 
 		 220 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 207 aa  147  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  42.19 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  37.44 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  41.62 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 220 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 210 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.4 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 230 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  38.86 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  40.1 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  38.78 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 240 aa  141  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  42.71 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  39.69 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0609  two component LuxR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  39.15 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.31 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.31 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 216 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 208 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.18 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  40 
 
 		 202 aa  138  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.38 
 
 		 208 aa  137  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.18 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 212 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  40.5 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  38.66 
 
 		 212 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 201 aa  137  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.4 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  39.11 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  40.21 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0436  two component LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  41.36 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  39.29 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  36.9 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3862  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  38.5 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  39.22 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  39.22 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>