More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5187 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 230 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  94.35 
 
 		 230 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  77.39 
 
 		 233 aa  357  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  54.31 
 
 		 212 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  51.46 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  50 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 210 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.06 
 
 		 209 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  52.79 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.25 
 
 		 213 aa  202  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 208 aa  201  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.04 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 212 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  48.98 
 
 		 200 aa  194  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.54 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.82 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 215 aa  191  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  49.04 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  49.04 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  48.78 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.74 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 209 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  49.23 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.28 
 
 		 213 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  50.51 
 
 		 204 aa  185  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 214 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 206 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 214 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 214 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 218 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  50.78 
 
 		 215 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  44.23 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.96 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 204 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  50.51 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.6 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.64 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  48.47 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.07 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2317  two component LuxR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5310  two component LuxR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5318  two component LuxR family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00034283  normal  0.590249 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  44.56 
 
 		 213 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 209 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  44.27 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  44.27 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7267  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.2 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  44.5 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5185  two component LuxR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  43.3 
 
 		 202 aa  158  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 203 aa  158  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  43.92 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  46.94 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 210 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 205 aa  154  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  45.24 
 
 		 330 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  44.21 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.95 
 
 		 201 aa  154  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 212 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  44.95 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  42.71 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  42.71 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>