More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3511 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 209 aa  425  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  75.25 
 
 		 200 aa  314  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  67.34 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  66.5 
 
 		 212 aa  274  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  66.5 
 
 		 212 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 212 aa  266  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.69 
 
 		 213 aa  265  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  58.08 
 
 		 212 aa  241  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  58.08 
 
 		 212 aa  241  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 220 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 214 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 214 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 214 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.25 
 
 		 210 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 224 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  53.61 
 
 		 219 aa  205  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7267  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 217 aa  204  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  51.24 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  50.73 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  50.52 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.55 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 212 aa  201  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 208 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.53 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.26 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  52.28 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2317  two component LuxR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  52.28 
 
 		 214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.45 
 
 		 215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  49.75 
 
 		 233 aa  196  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  51.28 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.06 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.48 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  48.98 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  49.49 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.04 
 
 		 230 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.21 
 
 		 213 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5318  two component LuxR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 247 aa  178  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00034283  normal  0.590249 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.98 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 226 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5310  two component LuxR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  41.21 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.23 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 223 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5185  two component LuxR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.07 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1946  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  42.35 
 
 		 202 aa  161  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  45.55 
 
 		 250 aa  157  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 210 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 210 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  41.03 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 241 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  43.72 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 205 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.32 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.92 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  43.62 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  43.62 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1465  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.64 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  43.08 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  40.82 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  42.13 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  39.9 
 
 		 216 aa  147  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  40.72 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  41.33 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  43.68 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  40.21 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  46.5 
 
 		 183 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  39.29 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  38.54 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>