More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25360 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  100 
 
 
246 aa  501  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  80 
 
 
212 aa  334  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  80.1 
 
 
212 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  77.99 
 
 
214 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  73.56 
 
 
209 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  73.56 
 
 
210 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  73.56 
 
 
210 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  62.8 
 
 
216 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  49.74 
 
 
210 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  49.74 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  49.74 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  49.74 
 
 
210 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
210 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  49.21 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.56 
 
 
220 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  48.68 
 
 
241 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
212 aa  175  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  46.39 
 
 
212 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  46.04 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  46.32 
 
 
202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
203 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
210 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
207 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  43.59 
 
 
210 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 
206 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  44.33 
 
 
212 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
212 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 
214 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  40.84 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 
214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2774  LuxR family DNA-binding response regulator  40.51 
 
 
216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  42 
 
 
212 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  42 
 
 
212 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 
209 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  42 
 
 
212 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
212 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
212 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
212 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  42 
 
 
212 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  42 
 
 
212 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  42 
 
 
212 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
212 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  42 
 
 
212 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
212 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
201 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
212 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
224 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  40.58 
 
 
212 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
212 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 
202 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  42 
 
 
202 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  42.08 
 
 
218 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 
224 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.3 
 
 
210 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
205 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  41.29 
 
 
216 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  40.91 
 
 
205 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
201 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  38.95 
 
 
198 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  41.21 
 
 
218 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.95 
 
 
201 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  44.5 
 
 
209 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  41.97 
 
 
208 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  41.5 
 
 
202 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  40.21 
 
 
208 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  41.88 
 
 
209 aa  154  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 
208 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
208 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
207 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  41.29 
 
 
208 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
214 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  40.72 
 
 
215 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  43.16 
 
 
214 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
207 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
203 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  41.03 
 
 
205 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  39.39 
 
 
203 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  39.49 
 
 
208 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.13 
 
 
209 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 
208 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
210 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
214 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  39.09 
 
 
205 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  38.1 
 
 
206 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
214 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
214 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  42.08 
 
 
209 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 
213 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  42.86 
 
 
204 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  40.91 
 
 
215 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
220 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
209 aa  149  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 
220 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  38.3 
 
 
202 aa  148  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  40.31 
 
 
210 aa  148  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
202 aa  148  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>