More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5633 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.92 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 210 aa  208  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 206 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  49.49 
 
 		 211 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  46.86 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  39.29 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  42.02 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  39.9 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.93 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  42.93 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  43.56 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  39.2 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 210 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.13 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.4 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  39.79 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3794  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.93 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.6 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  39.59 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1698  two component LuxR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000145996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  40.31 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 212 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  37.5 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.41 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 203 aa  138  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 202 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 226 aa  137  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  37.95 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  37.95 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  41.41 
 
 		 1483 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  38.66 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  40.62 
 
 		 211 aa  135  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 220 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  35 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 201 aa  134  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  41.54 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  39.02 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.51 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>