More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4053 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  80 
 
 		 205 aa  332  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  75.12 
 
 		 205 aa  316  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  74.15 
 
 		 205 aa  315  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  74.38 
 
 		 203 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  73.04 
 
 		 205 aa  307  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  71.22 
 
 		 205 aa  301  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  56.78 
 
 		 205 aa  225  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.79 
 
 		 205 aa  218  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  52.97 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  54.87 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  51.52 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  56.59 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  52.82 
 
 		 202 aa  195  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.82 
 
 		 202 aa  195  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  193  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  50 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  50.26 
 
 		 205 aa  191  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  48.45 
 
 		 204 aa  187  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  50.75 
 
 		 204 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 208 aa  186  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.57 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 208 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 212 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  45.03 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  43.88 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  44.1 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  44.28 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  42.29 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  40.61 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  40.31 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  40.31 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  40.31 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  40.31 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  40.31 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  40.31 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  40.31 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2088  two component LuxR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  44.62 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.93 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.93 
 
 		 211 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.31 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  42.29 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  42.49 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.23 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  41.41 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  42.35 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0666  response regulator receiver protein  41.45 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3732  response regulator receiver protein  41.97 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.63 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3675  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.97 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  41.97 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.51 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 203 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>