More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1578 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
207 aa  415  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  79.7 
 
 
203 aa  330  8e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  58.25 
 
 
205 aa  215  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  53.73 
 
 
213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  51.05 
 
 
205 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  59.46 
 
 
205 aa  201  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  57.29 
 
 
214 aa  201  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  56.41 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.61 
 
 
205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  50.77 
 
 
205 aa  198  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  54.08 
 
 
204 aa  197  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  51.58 
 
 
205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  49.21 
 
 
205 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  50.53 
 
 
203 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  50.48 
 
 
210 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  51.58 
 
 
205 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  48.42 
 
 
205 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  48.42 
 
 
205 aa  184  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  50 
 
 
204 aa  181  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  45.73 
 
 
209 aa  180  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
212 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
201 aa  179  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  47 
 
 
202 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  43.43 
 
 
208 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
207 aa  174  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  47 
 
 
203 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  43.22 
 
 
246 aa  173  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  43.88 
 
 
204 aa  171  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  43.22 
 
 
212 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  45.13 
 
 
209 aa  170  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
218 aa  170  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
210 aa  170  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 
212 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 
212 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 
212 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 
212 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 
212 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 
212 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 
212 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 
212 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 
201 aa  168  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
212 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
208 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  45.96 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
209 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.5 
 
 
213 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.11 
 
 
210 aa  165  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
210 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.97 
 
 
220 aa  164  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  44.1 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.6 
 
 
208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  45.6 
 
 
208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.08 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  42.5 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  44.56 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 
214 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
214 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  43.16 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  46.11 
 
 
207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  42 
 
 
214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  43.15 
 
 
212 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  45.18 
 
 
241 aa  161  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  41.97 
 
 
198 aa  161  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  42.78 
 
 
205 aa  161  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  44.67 
 
 
208 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  42.63 
 
 
210 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  45.08 
 
 
208 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 
210 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
210 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
210 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 
212 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
210 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.6 
 
 
213 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  42.63 
 
 
210 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
214 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  45.18 
 
 
210 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 
202 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  40.62 
 
 
233 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  42.13 
 
 
202 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  44.67 
 
 
210 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
206 aa  158  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1465  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 
247 aa  158  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 
210 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  42.08 
 
 
208 aa  157  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 
207 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
208 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  42.41 
 
 
210 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  46.23 
 
 
202 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>