More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3858 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3732  response regulator receiver protein  96.12 
 
 		 206 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  96.6 
 
 		 206 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3675  two component transcriptional regulator, LuxR family  96.12 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0666  response regulator receiver protein  95.57 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  88 
 
 		 203 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 203 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  51.56 
 
 		 200 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 203 aa  194  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02672  hypothetical protein  49.72 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0609  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 199 aa  187  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  46.45 
 
 		 191 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3862  response regulator receiver protein  40 
 
 		 200 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0436  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0467  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0451  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0478  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 200 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0534  response regulator receiver protein  38.95 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1997  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  40.98 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333764  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1065  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1500  response regulator  43.98 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000401264 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1955  response regulator  43.98 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1784  response regulator  43.98 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1521  response regulator  43.98 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  42.63 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1484  response regulator  43.46 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.58 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  39.89 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  41.05 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  44.92 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  43.62 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  43.62 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  41.45 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2282  two component LuxR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  42.41 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.15 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 201 aa  153  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  41.54 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2399  response regulator receiver protein  41.62 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  42.55 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1465  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.68 
 
 		 247 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  41.45 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  40.93 
 
 		 205 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  38.46 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  41.45 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2088  two component LuxR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.09 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 226 aa  148  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  41.97 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  42.27 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1969  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  38.86 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3683  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00690698  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0901  two component response regulator  41.28 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>