More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1065 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1065  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1500  response regulator  56.85 
 
 		 212 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000401264 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1521  response regulator  56.85 
 
 		 212 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1955  response regulator  56.85 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1784  response regulator  56.85 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1484  response regulator  56.35 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0436  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 202 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0534  response regulator receiver protein  40.84 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3862  response regulator receiver protein  41.58 
 
 		 200 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0901  two component response regulator  46.81 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0478  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.58 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0467  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0451  response regulator receiver protein  41.58 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0666  response regulator receiver protein  44.57 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3732  response regulator receiver protein  44.02 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  44.02 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3675  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  43.16 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02672  hypothetical protein  41.05 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0609  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  39.89 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2088  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 199 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  38.83 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  40.96 
 
 		 203 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  40 
 
 		 205 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  38.42 
 
 		 205 aa  151  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1438  LuxR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  40.96 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.58 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  38.25 
 
 		 191 aa  148  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  38.83 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.63 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1997  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  34.97 
 
 		 197 aa  145  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333764  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  38.62 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1969  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 212 aa  140  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  41.36 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.02 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  43.23 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 214 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  38.54 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 201 aa  137  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2282  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  41.71 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 		 211 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  38.86 
 
 		 213 aa  134  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 213 aa  134  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  38.62 
 
 		 210 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2399  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  36.51 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>