More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2282 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2282  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  403  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2088  two component LuxR family transcriptional regulator  66.83 
 
 		 199 aa  270  9e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1969  two component LuxR family transcriptional regulator  68.72 
 
 		 199 aa  254  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2399  response regulator receiver protein  56.63 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1416  DNA-binding response regulator  62.81 
 
 		 199 aa  234  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0609  two component LuxR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1997  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  43.39 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  41.62 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3675  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  43.32 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3732  response regulator receiver protein  41.24 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 203 aa  151  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  40.93 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0666  response regulator receiver protein  42.21 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 201 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  43.46 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0436  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  39.27 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 203 aa  148  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 206 aa  148  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0534  response regulator receiver protein  40.64 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3862  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  38.14 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  37.63 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0467  two component LuxR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0451  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0478  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.57 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  37.37 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  39.49 
 
 		 205 aa  141  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  36.32 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  40.1 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.37 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.65 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  38.14 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1484  response regulator  37.89 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1065  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1784  response regulator  37.89 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.83 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1955  response regulator  37.89 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1500  response regulator  37.89 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000401264 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1521  response regulator  37.89 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  38.12 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1438  LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  35.57 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  36.6 
 
 		 212 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  36.6 
 
 		 212 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  36.6 
 
 		 212 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  36.6 
 
 		 212 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  36.6 
 
 		 212 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  36.6 
 
 		 212 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  36.08 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  36.6 
 
 		 212 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  37.37 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02672  hypothetical protein  38.27 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 203 aa  134  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.08 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  36.08 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  35.6 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.43 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  35.83 
 
 		 250 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>