More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2130 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  91.26 
 
 		 207 aa  390  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  88.46 
 
 		 208 aa  377  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  88.46 
 
 		 208 aa  377  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  88.61 
 
 		 216 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  87.32 
 
 		 208 aa  374  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  85.37 
 
 		 208 aa  374  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  86.47 
 
 		 210 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  85.37 
 
 		 208 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  86.34 
 
 		 208 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  85.15 
 
 		 208 aa  362  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  69.65 
 
 		 210 aa  286  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  69.7 
 
 		 212 aa  285  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  69.19 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  69.19 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  69.19 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  69.19 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  69.19 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  69.19 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  69.19 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  68.69 
 
 		 210 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.07 
 
 		 214 aa  278  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 214 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  65.07 
 
 		 214 aa  278  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  69.15 
 
 		 210 aa  275  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.8 
 
 		 211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.32 
 
 		 211 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  68.72 
 
 		 215 aa  270  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.5 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  55.38 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.5 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  52.82 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  50.25 
 
 		 198 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  43.07 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 201 aa  181  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  45 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  43.5 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 201 aa  177  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  43.43 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  42.08 
 
 		 205 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 241 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  41.92 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 203 aa  171  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  42.49 
 
 		 250 aa  168  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  46.15 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  45.77 
 
 		 205 aa  167  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 203 aa  167  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  43.07 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  46.67 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0467  two component LuxR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0478  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.8 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0451  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 200 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  43.72 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  43.46 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0436  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  47.69 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  40.74 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  40 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3862  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  43.46 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  41.38 
 
 		 231 aa  161  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  42.93 
 
 		 202 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 202 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  42.35 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>