More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1438 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1438  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607012 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0901  two component response regulator  41.58 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1484  response regulator  38.5 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1784  response regulator  38.5 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1500  response regulator  38.5 
 
 		 212 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000401264 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1955  response regulator  38.5 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1521  response regulator  38.5 
 
 		 212 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1065  two component LuxR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175211 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02672  hypothetical protein  40.11 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0609  two component LuxR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0436  two component LuxR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0534  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  38.8 
 
 		 191 aa  142  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  37.7 
 
 		 200 aa  140  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  34.9 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0666  response regulator receiver protein  39.15 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3732  response regulator receiver protein  38.62 
 
 		 206 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  38.62 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3675  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 203 aa  138  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  41.88 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2282  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3862  response regulator receiver protein  34.9 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0478  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.9 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0451  response regulator receiver protein  34.76 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0467  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2088  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  39.41 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  36.51 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1997  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  35.52 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  33.5 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 207 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  39.38 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  35.03 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1969  two component LuxR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  39.79 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1416  DNA-binding response regulator  39.43 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  33.85 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.47 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 229 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.84 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  32.84 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  34.39 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  35.08 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.63 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  34.92 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.99 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2399  response regulator receiver protein  33.69 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  34.92 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  35.26 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.52 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  37.57 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  37.57 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  36.51 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  31.96 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  36.6 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.51 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  36.51 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  32.31 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  35.98 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>