More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3745 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  64.18 
 
 		 214 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.77 
 
 		 201 aa  184  9e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  48.98 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  49.49 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  44.39 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 208 aa  167  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  44.27 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  43.84 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.67 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3918  two component LuxR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  150  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  41.67 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0209  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  40.61 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  40 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  40.21 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  40.1 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.69 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.69 
 
 		 211 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  42.78 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.58 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  41.09 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.58 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  40.31 
 
 		 210 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 209 aa  140  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  41.18 
 
 		 204 aa  140  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 210 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3683  two component LuxR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00690698  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2282  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 199 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  40 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 241 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.31 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.43 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  40.82 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2399  response regulator receiver protein  37.37 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  40.93 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  40.61 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  40.8 
 
 		 205 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  38.3 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>