More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3041 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0609  two component LuxR family transcriptional regulator  55.85 
 
 		 199 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0534  response regulator receiver protein  55.91 
 
 		 200 aa  217  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0436  two component LuxR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3862  response regulator receiver protein  55.91 
 
 		 200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0467  two component LuxR family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 200 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0451  response regulator receiver protein  55.91 
 
 		 200 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0478  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.91 
 
 		 200 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1997  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  53.4 
 
 		 197 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  54.84 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  55.79 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  55.68 
 
 		 201 aa  211  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  52.72 
 
 		 200 aa  206  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02672  hypothetical protein  48.37 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  46.7 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3675  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 206 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3732  response regulator receiver protein  46.19 
 
 		 206 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  51.34 
 
 		 191 aa  194  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 206 aa  194  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0666  response regulator receiver protein  46.5 
 
 		 203 aa  193  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  42.93 
 
 		 210 aa  178  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  42.27 
 
 		 208 aa  175  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.78 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 208 aa  174  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  42.27 
 
 		 208 aa  173  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  44.5 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.27 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  41.12 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.61 
 
 		 211 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  41.24 
 
 		 215 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.61 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2088  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1065  two component LuxR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  43.16 
 
 		 198 aa  157  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  154  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1484  response regulator  41.08 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1521  response regulator  41.08 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1784  response regulator  41.08 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 214 aa  151  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1500  response regulator  41.08 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000401264 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1955  response regulator  41.08 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159918 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  40.21 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2282  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 199 aa  148  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203996 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  40.21 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2399  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1416  DNA-binding response regulator  43.46 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  40.72 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  36.65 
 
 		 216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  40.21 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  41.75 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  37.24 
 
 		 206 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1969  two component LuxR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  39.27 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3944  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.09 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.79 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0901  two component response regulator  38.82 
 
 		 196 aa  140  9e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  39.5 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  39.27 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>