More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0732 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  96.28 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  71.9 
 
 		 210 aa  307  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  70.48 
 
 		 210 aa  304  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  70.79 
 
 		 212 aa  291  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  70.79 
 
 		 212 aa  290  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  70.79 
 
 		 212 aa  290  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  70.79 
 
 		 212 aa  290  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  70.79 
 
 		 212 aa  290  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  70.79 
 
 		 212 aa  290  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  70.79 
 
 		 212 aa  290  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  70.79 
 
 		 212 aa  290  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 214 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  70.3 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  70.3 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  70.3 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  70.3 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  70.3 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 214 aa  288  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.59 
 
 		 214 aa  287  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  70.85 
 
 		 212 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  69.8 
 
 		 212 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  72.22 
 
 		 210 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  71.72 
 
 		 211 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  71.21 
 
 		 211 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  67 
 
 		 208 aa  271  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  68.72 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.34 
 
 		 208 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  68.34 
 
 		 208 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  66.17 
 
 		 208 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  66 
 
 		 210 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  65.82 
 
 		 207 aa  264  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  66.83 
 
 		 216 aa  264  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  64.68 
 
 		 208 aa  263  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  64 
 
 		 208 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.2 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  52.5 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.4 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  49.75 
 
 		 214 aa  181  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  44.9 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  46.77 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 209 aa  175  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  46.94 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  45.5 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 206 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 208 aa  168  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  43.43 
 
 		 205 aa  167  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  44.27 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0209  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  43.2 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.3 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.33 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  44.16 
 
 		 205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 240 aa  161  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  41.21 
 
 		 205 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  41.41 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  46.49 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.98 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  41.03 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  43.43 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  44.72 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  42.27 
 
 		 191 aa  158  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  41.46 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 210 aa  157  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 201 aa  157  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  42.05 
 
 		 250 aa  157  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  43 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  43.69 
 
 		 208 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  43.43 
 
 		 1483 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  43.22 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>