More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0907 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  96.53 
 
 		 202 aa  390  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.22 
 
 		 201 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  51.79 
 
 		 198 aa  194  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3918  two component LuxR family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.74 
 
 		 208 aa  175  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  48.98 
 
 		 203 aa  174  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  43.84 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  47.6 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.12 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  44.04 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  44.04 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  46 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  44.04 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  44.04 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  48.77 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  44.04 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  44.04 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  44.04 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  44.04 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  44.04 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 212 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  46.07 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.49 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  42.56 
 
 		 205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  40.39 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 207 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  42.41 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.49 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.45 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3683  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00690698  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1465  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0209  two component LuxR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  42 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  43.3 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  40.91 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.3 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.3 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  44.04 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  41 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  43.15 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  42.27 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  41.45 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  37.37 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 214 aa  151  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  44.27 
 
 		 210 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  41.5 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  44.27 
 
 		 210 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  43.81 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  41.5 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  40.4 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  45.99 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  148  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.45 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 203 aa  148  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  42.56 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.96 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.56 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  39.59 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3675  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.05 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>