More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4653 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4829  response regulator receiver protein  79.9 
 
 		 209 aa  332  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352064  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  79.81 
 
 		 216 aa  331  5e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  79.34 
 
 		 216 aa  330  9e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  78.47 
 
 		 209 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  78.16 
 
 		 208 aa  308  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  71.98 
 
 		 208 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  71.98 
 
 		 208 aa  291  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0209  two component LuxR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 225 aa  254  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3918  two component LuxR family transcriptional regulator  63.54 
 
 		 215 aa  234  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  56.65 
 
 		 198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.47 
 
 		 201 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  49.02 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3683  two component LuxR family transcriptional regulator  48.02 
 
 		 205 aa  174  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00690698  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  47.55 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3745  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  46.19 
 
 		 208 aa  167  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  45.85 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  48.21 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  47.32 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  42.44 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  42.44 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  42.44 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  42.44 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  42.44 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  42.44 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  42.44 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  42.44 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  42.93 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  39.61 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  44.5 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  41.5 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.43 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.51 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  41.75 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  43.41 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  41.95 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 214 aa  151  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 208 aa  151  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  43.41 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.36 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.36 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  42.36 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  41.58 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  43.69 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  41.9 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  40.59 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  43.84 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  42.57 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  40.98 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  40.69 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  41.75 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  42.36 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>