More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3839 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 224 aa  255  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.08 
 
 		 210 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  57 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  55 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  56.99 
 
 		 210 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 215 aa  228  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  54.36 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.95 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  54.36 
 
 		 212 aa  224  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.67 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  55.05 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  54.04 
 
 		 220 aa  221  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7267  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 218 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 212 aa  215  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 208 aa  214  8e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2317  two component LuxR family transcriptional regulator  53.3 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.81 
 
 		 221 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.2 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.25 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  53.09 
 
 		 219 aa  207  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  49.24 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 209 aa  205  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  49.75 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  51.74 
 
 		 212 aa  201  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5318  two component LuxR family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00034283  normal  0.590249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.3 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  47 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  49.24 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.28 
 
 		 230 aa  194  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1946  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.11 
 
 		 220 aa  194  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.49 
 
 		 228 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5310  two component LuxR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  48.47 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  45.27 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  47 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  47 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 204 aa  188  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  46.97 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  44.78 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5185  two component LuxR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 213 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  49 
 
 		 330 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  44.28 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.28 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  43.94 
 
 		 202 aa  174  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.23 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  48 
 
 		 330 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  45.36 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  43.35 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  43.35 
 
 		 210 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5708  two component LuxR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0231  two component LuxR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 330 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1915  two component LuxR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 135 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.463472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  41.45 
 
 		 210 aa  157  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  39.3 
 
 		 246 aa  157  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  39.91 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  41.12 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3794  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 241 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.15 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  40.61 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>