More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3713 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  418  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 212 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  56.57 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.59 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  58.03 
 
 		 215 aa  228  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.89 
 
 		 210 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.54 
 
 		 209 aa  221  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  52.55 
 
 		 200 aa  219  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 214 aa  218  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  52 
 
 		 212 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 212 aa  216  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  52.53 
 
 		 204 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.76 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  48.74 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.21 
 
 		 210 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.02 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.36 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2317  two component LuxR family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 209 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 210 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  52.33 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  52.33 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 204 aa  201  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 212 aa  201  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  52.55 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  49.49 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.11 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 208 aa  195  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  51.85 
 
 		 208 aa  194  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  52.28 
 
 		 240 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.88 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  50.25 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 214 aa  187  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.72 
 
 		 228 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.83 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  44.39 
 
 		 206 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.5 
 
 		 213 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.48 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7267  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.72 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5708  two component LuxR family transcriptional regulator  53.65 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  47.8 
 
 		 233 aa  183  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  46.94 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  47.72 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  53.29 
 
 		 183 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5318  two component LuxR family transcriptional regulator  52.81 
 
 		 247 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00034283  normal  0.590249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  46.46 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.73 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.37 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  43.16 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  43.16 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  44.88 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.29 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5310  two component LuxR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  43.68 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  41.71 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3794  response regulator receiver protein  49.72 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  42.35 
 
 		 246 aa  164  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.07 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  41.21 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  41.21 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  41.21 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  41.21 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  41.21 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  41.21 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  42.64 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>