More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2459 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  74.76 
 
 		 212 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  59 
 
 		 224 aa  254  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  55.83 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.82 
 
 		 220 aa  241  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  53.55 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  54.03 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.88 
 
 		 210 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  57 
 
 		 212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2317  two component LuxR family transcriptional regulator  57.44 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 210 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5310  two component LuxR family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 228 aa  228  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.92 
 
 		 210 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.67 
 
 		 221 aa  223  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.22 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.88 
 
 		 209 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  50.72 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  58.95 
 
 		 214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  58.95 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  56.63 
 
 		 208 aa  211  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  53.06 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  56.83 
 
 		 208 aa  208  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  50.25 
 
 		 204 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 228 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  48.26 
 
 		 209 aa  205  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  51.71 
 
 		 212 aa  204  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7267  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.97 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.27 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  50.24 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.24 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5318  two component LuxR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 247 aa  198  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00034283  normal  0.590249 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  49.75 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  49.03 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  49.75 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  51.55 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.26 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5185  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 213 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.51 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.75 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.74 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1915  two component LuxR family transcriptional regulator  64.18 
 
 		 135 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.463472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.88 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  47.47 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  46.04 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5708  two component LuxR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1946  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.18 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  42.56 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  42.35 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 214 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  42.38 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 209 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 205 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  45.03 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>