More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4615 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  61.61 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  61.24 
 
 		 224 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.66 
 
 		 220 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 214 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 214 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 214 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.88 
 
 		 221 aa  215  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.81 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.81 
 
 		 222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  49.27 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  52.06 
 
 		 212 aa  208  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 219 aa  207  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.51 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  51.27 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2317  two component LuxR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  50.75 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7267  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  50.51 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.74 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 212 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  48.99 
 
 		 200 aa  194  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.76 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  49.72 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  46 
 
 		 204 aa  184  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  44.33 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5318  two component LuxR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00034283  normal  0.590249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  46.97 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  45.23 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.81 
 
 		 223 aa  178  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  44.95 
 
 		 212 aa  178  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  44.95 
 
 		 212 aa  178  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  45.41 
 
 		 233 aa  174  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  44.88 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  44.88 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5185  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5310  two component LuxR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1946  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.18 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  42.18 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.5 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  42.05 
 
 		 206 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  161  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  44.15 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  46 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  42.08 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1915  two component LuxR family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 135 aa  154  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.463472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  41.5 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  41.5 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  41.5 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  41.5 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  41.5 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  41.5 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  41.5 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  43.68 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  41 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  41.94 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.65 
 
 		 201 aa  151  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 210 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.93 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0666  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 203 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.61 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  41 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3675  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>