More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2445 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  57.79 
 
 		 204 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5708  two component LuxR family transcriptional regulator  55.76 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306208 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  52.13 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.55 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  50.25 
 
 		 212 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  46.46 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  49.49 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 215 aa  184  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  58.79 
 
 		 183 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.51 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.94 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.98 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.72 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.74 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 214 aa  178  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 210 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.78 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 208 aa  174  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  45.45 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.85 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 212 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  43.6 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2317  two component LuxR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.46 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 206 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  44.33 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 206 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5310  two component LuxR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.36 
 
 		 222 aa  162  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7267  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.65 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  45 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5318  two component LuxR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00034283  normal  0.590249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  42.21 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5185  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  42.93 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  38.69 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.56 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 210 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  40 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  39.41 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  38.92 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  38.92 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  38.92 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  41.62 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  38.92 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  38.92 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  38.92 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  38.92 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  40.1 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.1 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  40.3 
 
 		 202 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  38.78 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.58 
 
 		 211 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 208 aa  144  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 208 aa  144  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  39.49 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 218 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 210 aa  141  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>