More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7459 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  52.36 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  52.36 
 
 		 212 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.09 
 
 		 210 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  49.26 
 
 		 212 aa  207  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.28 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  51.28 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.61 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  52.06 
 
 		 208 aa  201  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 212 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 215 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  50.77 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.24 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  46.34 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 210 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 222 aa  191  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 208 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2317  two component LuxR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 209 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 230 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 212 aa  187  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.33 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.78 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  46.33 
 
 		 233 aa  185  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 212 aa  184  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 212 aa  184  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.4 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.53 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  44.78 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  45.85 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  45.18 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7267  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  45.59 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5318  two component LuxR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00034283  normal  0.590249 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5310  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1946  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.89 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5185  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  38.78 
 
 		 205 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  38.24 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  40.91 
 
 		 202 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5708  two component LuxR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 221 aa  148  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  38.65 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  38.65 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  38.65 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  38.65 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  38.65 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  38.65 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  43.16 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.31 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  38.65 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0231  two component LuxR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 330 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  38.65 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  39 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  42.56 
 
 		 330 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  39 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>